科学并不等于真理，科学也有自身局限。科学（science），这个单词来源于拉丁文scienta，意思是知识和学问。
科学依靠人类感官（视觉、听觉、嗅觉、味觉、触觉）觉察和大脑加工为基础。而人类感官和大脑本身是主观的，决定了科学也是主观的。有人会说不是还有很多仪器吗？仪器也是需要人眼睛来看，仪器只是人感官的延伸。科学是人类主观认识世界的工具。
科学是一种经验主义的认识论，有经验主义的巨大缺陷：它永远不能产生绝对正确的真理。这是归纳法的本质决定的。举一个简单的例子，在发现澳大利亚存在黑天鹅前，当时世界上除澳大利亚所有人都认为天鹅是白色的。因为当时观测到的所有天鹅都是白色的。
科学并非简单地对自然加以描述与解释，它是自然与我们的自我相互影响的产物，它对自然的描述基于我们对自然提问的方式。
比如说，科学家看见一群蚂蚁在搬家，于是科学家思考它们为什么搬家，于是观察了很多蚂蚁，不同环境下的，不同种类下的，不同时间下的蚂蚁，看起来够严谨够科学吧？最后论证，因为天快要下雨了，它们开始搬家，由此可见蚂蚁能感知空气湿度对天气变化比较敏感。你说这科学吗？看起来做了一系列观众和实验是很科学，但也许一开始提出的问题就具有主观性，它们也许并不是在搬家，也许它们是在锻炼身体？或者就是某个仪式？我们看着它驼了东西就说它们在搬家？然后以这个主观提问进行“科学”论证，最后得出结论是客观科学的吗？
这就是我们大脑的工作方式，如果大脑没有预先设定你将知觉到某个物体（大脑没有觉得蚂蚁不是在搬家），它便把这个物体阻隔在你的意识之外（大脑就不会去想“搬家”之外的可能），我们对现实的知觉会被我们的预期（蚂蚁这就是在搬家）所左右，从这一刻起就是主观的了。
科学是一个历史发展的过程，任何一种科学理论都不是绝对正确的，一个时期它是正确的，后面又被修正，后面的理论使前面的理论变得局部正确，有条件的正确，而不是绝对正确，比如牛顿力学在诞生时是标准的科学理论，但是有了相对论以后，就变成局部正确的理论，爱因斯坦自己说过他的理论以后也会被推翻。
宇宙是怎么诞生的，主流科学解释是奇点大爆炸；如果多问科学一句：奇点怎么来的？科学目前无解。 科学解释世界永远没有终极答案，不管再前进多少步，总会还有为什么在前面等着，永远没有逻辑自洽的一天。难怪爱因斯坦晚年会信仰宗教，当然他信的并不是人格化的神，而是斯滨诺沙描述的神，类似于自然。杨振宁在一次交流会上也说他发现妙的东西太多了，不可能是偶然，相信有个造物者，当然这个造物者不是人的形象，但名字无所谓，叫什么都可以。
科学理论总是成体系的，每个体系都有那么几条原理作为其根基。一个体系内的论必定相融，没有重大矛盾。根基不可变，但外围理论可以修改。如果触及根本理论，则成为一个新的范式：范式转移。古典物理学是亚里士多德打底，以其为基础发展而来；经典物理的核心是牛顿定律，是对惯性系的公设；双缝干涉实验是量子力学的起点。但是托马斯·库恩发现，这些不同的范式不能说哪个是对哪个是错，因为核心理论都是无法证明的（就像公理一样无法证明），仅仅是与当下实验结果相符而已，归根究底来自于感官和大脑观察。其它后续理论在各自体系的前提假设之下都是对的，但放到其它范式下，错得幼稚。假设的前提不同，不同范式之间没有可比性，【不可通约】。
多数科学家跟普通人一样默认自己信奉的范式是正确的。人类因为各种原因拒绝改变观点，学术理论的演化还要屈从于学术环境随波逐流。在科学理论发展过程中，就算发展出与当前范式不符的东西，通常也被人们当成实验误差或者干脆对结果搁置不理。直到积累到一定程度，发生科学革命。只有光芒万丈的带头大哥建立新的范式，两套范式相互竞争最终发生范式转移。正如拉卡托斯所说：“在一个更好的理论出现之前是不会有证伪的。”科学也从来不是什么纯粹理性的活动，是主观的学科，走实践道路的玄学。人类从未走出玄学。
科学越向前发展，我们越是发现我们的无知：因为我们积累的科学知识使我们可见的与未知相界的面积越大；另一方面，错误的知识也在同样迅速的成长，并没有因为科学的一日千里和不断纠错有丝毫改善。
科学≠真理，科学是对世界的一种解释，是众多解释中的一种，也许是当下最接近真理的代言者。科学很重要的一个特性就是它是可证伪的，所以我们见证了从“地心说”到“日心说”的转变，后来日心说也被证实是错误的，这就告诉我们对科学要保持怀疑态度，因为科学随时可能被推翻。不能把科学等同于真理，要不会神化了科学，把科学当宗教信仰，会信奉上科学教，科学真正价值也就消失了！
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